橘发少年黑崎一护是个正义感爆棚的高中生，与父亲、两个妹妹共同生活，从小他就有能看见鬼魂的本事，但并不以为意。一天夜里一只叫“虚”的怪物攻击了一护和他的家人，尾随怪物而来的死神朽木露琪亚身负重伤，只得将灵力转给一护，由他代死神之职。岂料“代职”一发不可收拾，一段时间后，尸 魂界发现露琪亚的违规行为，来人将她抓走。为救出朋友，一护在浦原商店店主浦原喜助的帮助下，集结了井上织姬、石田雨龙、茶渡泰虎几位好...

被称为海贼王的男人[布鲁滋]，所遗留的遗产是价值100亿宇宙币的沉睡之星[グレイスラント]。这里正迎来战末，收拾残局的统合政府宣布星球爆破。　　被剥夺权利的一些被称为「コヨーテ」的海贼以及继承布鲁滋遗产的的少女拂兰卡，为了取回布鲁滋的遗产而遭受マルチアーノ率领的杀手团的狙击。于是，他们潜藏于公会、警察的包围之中。渐渐临近グレイスラント沉睡之星的「コヨーテ」会发现隐藏在这星球上的一百亿宇宙币吗？...

一天毛利小五郎收到一张请帖，里面是谜样男子的委托，需要前往横滨的一个游乐场。小五郎和柯南一行人快乐地到达欢乐的游乐场，还带上了可以出入无阻代表VIP的手表，不料正中那名神秘男子的圈套。所有带上手表的人不得离开游乐场，否则便会发生爆炸。从现在开始到晚上十点，柯南和小五郎如果不能解开谜题，兰和少年侦探团也会随着游乐园粉身碎骨。然而更意想不到的是，那名男子居然直接称呼柯南为工藤新一。...

一年一度的七夕即将到来，东京、神奈、静冈、长野等地却接连发生六起连环杀人案，被害者身边皆留下麻将牌中的七筒和奇怪暗示。由于作案范围过大，各地警署探员纷纷聚到东京警署的专案组共同研究案情，毛利小五郎也被邀请参加，柯南则偷偷听取了会议的内容。会后，柯南无意中听到群马县警部山村操哼唱的童谣，继而发现有黑衣组织的成员混进警察中间。在一次围捕行动中，柯南遇到假扮人质的Vermouth，得知近期一连串的杀人案...