小智和皮卡丘等一行伙伴在旅途中前行。某日，宝可梦波尔凯尼恩从天而降并被迫与小智锁在了一起。波尔凯尼恩与被人类伤害过的宝可梦们共同生活，因此非常讨厌人类，但这条神奇的锁链却让他们无法分开，奇妙的故事就此开始。小智与皮卡丘又将一起开始新的冒险…… 另一方面，在超级机关城市阿佐特王国，大臣贾维斯得到了常年追求的终极发明——500 年前诞生于阿佐特王国的人造宝可梦玛机雅娜。据说在玛机雅娜体内，有被称为 “魂心”的未知力量，贪婪又邪恶的贾维斯企图利用这股力量来统治王国。小智和波尔凯尼恩将会如何化解彼此的嫌隙？波尔凯尼恩与玛机雅娜又有着怎样的渊源？他们要如何共同对抗贾维斯拯救阿佐特王国？玛机雅娜的最终命运又将如何结局？一场精灵宝可梦史上最伟大的战役即将展开！
高山南 山崎和佳奈 茶风林 绪方贤一 盐泽兼人 神谷明 林原惠美 岩居由希子 高木涉 大谷育江 松井菜樱子 田中信夫 堀川亮 松冈文雄 石冢运升 宫村优子 大塚周夫 依田英助 大塚芳忠 筱原惠美 宫本充 壤晴彦 中岛聪彦 小山裕通 井上隆之 千叶一伸 布目贞雄 佐藤忍 藤田淑子 山口胜平
高山南 堀川亮 山口胜平 山崎和佳奈 宫村优子 神谷明 绪方贤一 林原惠美 岩居由希子 高木涉 大谷育江 松井菜樱子 置鲇龙太郎 若本规夫 茶风林 井上和彦 汤屋敦子 井原启介 中村大树 龟井三郎 游佐浩二 水内清光 三户耕三 里内信夫 安达麻里 铃木弘子 佐久间玲 一龙斋贞友 松本幸 千叶一伸 菅原淳一 铃置洋孝
松本梨香 大谷育江 石冢运升 饭冢雅弓 兴梠里美 关智一 林原惠美 三木真一郎 犬山犬子 大塚周夫 平松晶子 久川绫 三石琴乃 潘惠子 丰岛雅美 爱河里花子 冬马由美 小西克幸 金井美香 上田祐司 坂口候一 筱原惠美 加贺谷纯一 挂川裕彦 西村千奈美 伊崎寿克 酒井哲也 川岛得爱 鹿贺丈史 浜田雅功 山寺宏一
矢岛晶子 楢桥美纪 藤原启治 兴梠里美 真柴摩利 林玉绪 一龙斋贞友 佐藤智惠 玄田哲章 小樱悦子 爱河里花子 樱井智 堀内贤雄 龙田直树 木村雅史 仓田雅世 那须惠 筈见纯 足立友 真堂圭 村上信五 大仓忠义 大西健晴 田中一成 阪口周平 浦山迅 乃村健次 井上喜久子 川浪叶子 山野史人
栗田贯一 增山江威子 小林清志 井上真树夫 纳谷悟朗 小山茉美 松本梨香 中田让治 松冈文雄 峰惠研 秋元羊介 坂东尚树 小山武宏 田原阿尔诺 谷昌树 鸟畑洋人 横尾博之 清水敏孝 永田亮子