小智（松本梨花 配音）带着皮卡丘（大谷育江 配音），和同伴们继续前行在冒险的旅途之中。路上，一行人遇见了带着神奇宝贝胡巴（钉宫理惠 配音）的少女麦亚丽（中川翔子 配音）。胡巴能够制造出神奇的时空圆环，带领大家在不同的地点来回穿梭。 地处沙漠腹地的城市迪赛鲁西坦到了，曾经，在这里发生过一场声势浩大的神奇宝贝战争，亦是因为这场战争，这里才成为了干涸少水的沙漠。在这里，麦亚丽和哥哥巴尔扎（藤原龙也 配音）汇合了，让大家没有想到的是，巴尔扎竟然得到了封印着可怕神奇怪手的瓶子。在误打误撞之中，封印被解开了，那个曾经终结过迪赛鲁西坦的可怕怪兽重见天日，而它的真实身份，竟然是超胡巴（山寺宏一 配音）。
高山南 山崎和佳奈 茶风林 绪方贤一 盐泽兼人 神谷明 林原惠美 岩居由希子 高木涉 大谷育江 松井菜樱子 田中信夫 堀川亮 松冈文雄 石冢运升 宫村优子 大塚周夫 依田英助 大塚芳忠 筱原惠美 宫本充 壤晴彦 中岛聪彦 小山裕通 井上隆之 千叶一伸 布目贞雄 佐藤忍 藤田淑子 山口胜平
高山南 堀川亮 山口胜平 山崎和佳奈 宫村优子 神谷明 绪方贤一 林原惠美 岩居由希子 高木涉 大谷育江 松井菜樱子 置鲇龙太郎 若本规夫 茶风林 井上和彦 汤屋敦子 井原启介 中村大树 龟井三郎 游佐浩二 水内清光 三户耕三 里内信夫 安达麻里 铃木弘子 佐久间玲 一龙斋贞友 松本幸 千叶一伸 菅原淳一 铃置洋孝
松本梨香 大谷育江 石冢运升 饭冢雅弓 兴梠里美 关智一 林原惠美 三木真一郎 犬山犬子 大塚周夫 平松晶子 久川绫 三石琴乃 潘惠子 丰岛雅美 爱河里花子 冬马由美 小西克幸 金井美香 上田祐司 坂口候一 筱原惠美 加贺谷纯一 挂川裕彦 西村千奈美 伊崎寿克 酒井哲也 川岛得爱 鹿贺丈史 浜田雅功 山寺宏一
矢岛晶子 楢桥美纪 藤原启治 兴梠里美 真柴摩利 林玉绪 一龙斋贞友 佐藤智惠 玄田哲章 小樱悦子 爱河里花子 樱井智 堀内贤雄 龙田直树 木村雅史 仓田雅世 那须惠 筈见纯 足立友 真堂圭 村上信五 大仓忠义 大西健晴 田中一成 阪口周平 浦山迅 乃村健次 井上喜久子 川浪叶子 山野史人
栗田贯一 增山江威子 小林清志 井上真树夫 纳谷悟朗 小山茉美 松本梨香 中田让治 松冈文雄 峰惠研 秋元羊介 坂东尚树 小山武宏 田原阿尔诺 谷昌树 鸟畑洋人 横尾博之 清水敏孝 永田亮子